2018年9月5日14:00，美国华盛顿大学邱肖杰博士后受邀来访我院，为众师生带来一场题为“ Inferring developmental trajectoriesand causal requlations with single-cell measurements”的学术报告，报告由我院翁杰敏教授主持。

邱肖杰博士后，2008年本科毕业于长春科技大学生物工程专业，2012年在华东师范大学获得生物信息学硕土学位，2018年在华盛顿大学获得分子与细胞生物学专业博士学位，目前是美国华盛顿大学的博士后。邱博士ー直从事计算生物学与单细胞基因组学的研究，已作为第一作者在 Nature method杂志上发表论文2篇。

在这次研讨会中，邱肖杰博后介绍了一些关于工具包Monocle 2的工作，并简要地谈了他最近在单细胞RNA-seq数据集上重建发展轨迹和推断因果调控网络的工作。自去年单细胞基因组学(Monocle 2)出版以来，单细胞基因组学领域取得了巨大的进步，一个新兴的主题是人们正在产生越来越复杂的大规模细胞图谱数据集。这些数据集带来了巨大的计算挑战。为了应对这些挑战，他最近致力于开发单Monocle 3。在Monocle 3中，他提供了分析包含数百万个细胞的复杂数据集的计算方法，并改进了差异表达测试，以识别空间相关基因。为了将单细胞规模扩展到数百万个细胞，在单细胞3中，他提供了一个更巧妙的工作流程，它从识别高度分散的基因或不同细胞间差异很大的基因开始，然后用线性降维方法(PCA)对数据集进行规范化，并降低数据的维数。最后，邱肖杰博后展望了一下未来，希望在他所学到的基础上，在空间、时间等上恢复监管网络,利用seqFISH和MEMOIR来实现这一目标。

非常精彩的报告结束后，聆听报告的老师和同学们竞相提出专业问题，并与邱肖杰博后展开了热烈的问答和深入的讨论，现场极其活跃，此次研讨会，不仅丰富了师生们的学术知识，而且让大家学到了不同领域科学问题的研究思路，相信这是一场令每个人受益匪浅的报告。